法的比较研究中,10×Genomics也比其他高通量方法如Drop-seq和Indrops[33]具有更高的灵敏度,更高的与线粒体基因匹配的reads比例,更低的噪声ytemc⊙ com利用10×Genomics和Smart-seq2平台,可以通过不同的免疫球蛋白重链特征区分CRC中B细胞的亚群,聚类结果无明显差异ytemc⊙ com但是,10×Genomics也有不足之处,它不能覆盖所有的基因,并且存在3区域偏倚,在检测基因突变或mRNA剪接位点时可能会遗漏一些重要信息ytemc⊙ com此外,这种方法对细胞质量有更高的要求,不同的组织和不同的获取样本的方法都不同ytemc⊙ com利用scRNA-seq,我们可以更精确地定义细胞的亚型,追踪它们的发育谱系,确定克隆型和表现型之间的关系,绘制不同细胞之间的相互作用和空间关系图,从而从多个维度描述TMEytemc⊙ com此外,还需要通过一系列体内和体外实验来验证结果ytemc⊙ com我们总结了使用scRNA-seq研究的最新出版物
B细胞受体(Bcellreceptor,BCR)是一种能识别并结合特异性抗原的膜免疫球蛋白,在B细胞的分化成熟过程中起着重要作用ytemc⊙ comBCR由两条重链和两条轻链组成,其中可变(V)、多样性(D)和连接(J)基因序列的重组创造了B细胞的多样性ytemc⊙ com这种多基因的复杂性使得鉴别不同的受体变得困难ytemc⊙ com然而,由于每个B细胞通常表达一个单一的受体,潜在的抗原特异性受体可以通过给定的原细胞链发现ytemc⊙ comBCR的两个主要功能如下ytemc⊙ com首先,它通过诱导B细胞激活过程中肌动蛋白骨架的实质改变和各种基因的表达来激活B细胞ytemc⊙ com其次,它介导抗原的鉴定和提取,从而导致加工过的肽在主要组织相容性复合体II(MHCII)上呈现给T辅助细胞ytemc⊙ com因此,BCR测序有助于进一步了解B细胞分化的轨迹及其特异性识别抗原性的机制,特别是当与单个B细胞的完整转录组身份配对时,这为了解癌症的发展提供了线索ytemc⊙ com更重要的是,BCR测序可以追踪来自单细胞的群体,揭示克隆型和表型之间的关系ytemc⊙ comScRNA-seq技术在BCR测序中具有天然优势,因为含有UMI的微流控系统可以保证同源VH-VL配对的保存,而这些同源