量RNA测序显示,B细胞相关标记物在免疫治疗应答者和非应答者之间表达差异最大ytemc⊙ comB细胞以三种方式攻击癌症:1.分泌免疫球蛋白介导抗体依赖性细胞毒性、抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP)和补体依赖性细胞毒性(CDC);2.抗原提呈激活T细胞;3.分泌GranzymeB、肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)和IFNγ直接杀伤肿瘤细胞ytemc⊙ com因此,肿瘤浸润B细胞(TIL-Bs)可能对肿瘤预后有重要意义,并可作为预测免疫治疗的生物标志物ytemc⊙ com然而,专注于B细胞的研究比专注于T细胞的研究要少得多,这使得它们在癌症免疫治疗中的复杂机制不清楚ytemc⊙ com随着scRNA-seq技术的发展,TIL-Bs的位置和功能可以被精确地确定,这可能有助于更好地理解其机制ytemc⊙ com从单细胞的角度来看,在本文中,我们讨论TIL-Bs亚种群分化轨迹,与其他细胞的相互作用,并总结B细胞的机制调节时间和影响免疫治疗效果,旨在为肿瘤研究提供一种新的方式针对B细胞ytemc⊙ com
单细胞测序可以进一步探索肿瘤内的异质性ytemc⊙ com与流式细胞术、质谱法或其他任何以前的方法不同,单细胞测序是一种连续的方法,而不是离散的方法ytemc⊙ comscRNA-seq的步骤主要包括以下四个步骤:(1)单细胞分离,(2)反转录成cDNA,(3)PCR扩增cDNA,(4)测序库构建(图1a)ytemc⊙ com荧光激活细胞分选(FACS)可用于从组织中分离特定的细胞(图1a)ytemc⊙ com在B细胞研究方面,采用流式细胞术筛选CD45+细胞,增加B细胞的比例;也可根据B细胞标记物直接选择靶向B细胞ytemc⊙ com作为scRNA-seq技术的突破,微流控系统将单个细胞封装在独立的微液滴中,该微液滴包含一个独特的分子标识符(UMI),用于对单细胞内的微转录材料进行条形码ytemc⊙ com根据每个细胞的UMI,即使细胞被裂解,在后续的分析中也可以找到转录信息ytemc⊙ com基于这一特点,10×GenomicsChromium平台同时测序数千个细胞ytemc⊙ com与Smart-seq2等低通量方法相比,10×GenomicsChromium平台因其成本低、效率高而被更广泛地应用于B细胞检测ytemc⊙ com
在对多种scRNA-seq方